旅行社营业部开独立账户有风险，包括财务风险、经营风险、税务风险。
1、财务风险：如果旅行社营业部开立的账户管理不善，存在财务管理漏洞，导致资金被挪用、财务造假等风险。
2、经营风险：开立独立账户后，营业部会独立经营、独立制定经营计划，从而导致公司整体经营战略受到影响，甚至会与公司总部产生矛盾。
3、税务风险：如果在开立独立账户的过程中，旅行社营业部没有按照税务规定缴纳税款，或者存在虚开发票等行为，会触犯税务法规，导致税务问题的发生。
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